大阪大学免疫学フロンティア研究センター ヒト免疫学(単一細胞ゲノミクス)奥崎研究室

研究内容Research

ヒト免疫学(単一細胞ゲノミクス)ラボは世界トップレベルの免疫学拠点と大阪大学医学部、ヒト免疫学の基礎・臨床が密接に存在する地の利を活かす戦略とし、基礎研究と臨床研究に関わらずシングルセル解析技術を用いて免疫学を発展させるため2019年11月に発足した。

同ラボは大阪大学微生物病研究所・遺伝情報実験センター・ゲノム解析室と人的ソースと解析環境を有機的に共有している。
シングルセル解析をより迅速に行えるよう同時に数万細胞を処理可能なシングルセル解析機器(Chromium (10xGenomics), Rhapsody express(BD))、また数万個由来の遺伝情報について配列決定可能なハイスペックの次世代シークエンサー(NovaSeq6000(Illumina))、そして産生される遺伝情報配列を処理し、保存するための大型計算機サーバーを導入した。IFReC研究グループと連携し、免疫研究に関する100検体以上の結果をすでに保有している。

現在、ゲノム解析室と連携し、シングルセル解析機器と次世代シークエンサーから解読される免疫細胞に特化した細胞と遺伝子マトリックスから生物学的な意義を迅速・正確に解釈を行うためデータベース構築を目指している。
シングル免疫細胞データベースとして質・量ともに国内・国外最大級を目指し、単なるデータ保管ではない共有化や検索・解析手法の構築を継続中である。

The Human Immunology (Single Cell Genomics) Lab is a strategy that takes advantage of the fact that the world's top-level immunology center, Osaka University School of Medicine, and the basic and clinical aspects of human immunology are closely located. It was launched in November 2019 to develop immunology using cell analysis technology.

The laboratory organically shares human sources and analysis environment with the Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Genetic Information Experiment Center, and Genome Analysis Room. Single-cell analysis equipment (Chromium (10xGenomics), Rhapsody express (BD)) that can process tens of thousands of cells at the same time for faster single-cell analysis, and high-spec that can sequence genetic information derived from tens of thousands of cells. We introduced a next-generation sequencer (NovaSeq6000 (Illumina)) and a large computer server for processing and storing the genetic information sequences produced. In collaboration with the IFReC research group, we already have more than 100 results on immunology research.

Currently, in collaboration with the Genome Analysis Office, we aim to build a database to quickly and accurately interpret biological significance from cells specialized in immune cells and gene matrices that are decoded by single-cell analysis equipment and next-generation sequencers. ing. Aiming to be one of the largest single immune cell databases in Japan and overseas in terms of both quality and quantity, we are continuing to build sharing and search / analysis methods that are not just data storage.

奥崎大介